Denna kurs hålls till stor del som lärarledda övningar. Kursen ger erfarenhet och kunskap i programmering i allmänhet och i Python i synnerhet. Fokus är speciellt på bioinformatiska tillämpningar. Arbetet sker i Linux-miljö och kursen kommer utveckla studentens kunskaper inte bara i Python men också i Bash (kommandoskal) och CGI (Common Gateway Interface).This hands on course will give you experience and knowledge of programming in general and in Python  in particular. The focus is especially on applications in bioinformatics. Working environment is Linux and the course will develop the students’ skills in Python but also in Bash and CGI (Common Gateway Interface).    

Kursen primära syfte är att studenterna ska förvärva djupare insikter om och färdigheter i grundläggande koncept och verktyg för jämförande sekvensanalys, inkluderande olika typer av primära och sekundära sekvensdatabaser. Kursen ingår i masterprogrammet i Bioinformatik Kursen BINP17 kan läsas i kombination med kursen BINP16 Programmering i Python7.5 hp och ingår i masterprogrammet i bioinformatikBioinformatics, the application of computational methods to biological and biomedical problems, is a rapidly growing field. Modern biochemists and biologists need to have a basic knowledge of bioinformatics. This course provides both a practical and a theoretical overview of database searching, sequence alignment, phylogenetic analysis, gene prediction and genome analysis. BINP17 can be taken eith

I kursen ingår sammanfogning av genom-, transkriptom- och amplikondata samt en första analys av resultaten i form av genprediktion (för genom), samt expressionsanalys (för transkriptom). Gener och transkript annoteras på en grundläggande nivå. Studenterna genomför flera övningar i hur kommandoskal fungerar samt ett flertal programmeringsuppgifter i Python. Under kursen genomförs en individuell proThis hands on course will give you the experience and provide the tools that are needed to analyze next generation sequencing data. It is particularly focused on the analysis of: transcriptome data amplicon data genome data Working environment is Linux and the course will develop the students’ skills in Bash and Python. Covered areas are: assemblies differential expression varia

Efter assemblering av data, genererade med nya sekvenseringsmetoder såsom ”next generation sequencing”, måste resultatet knytas till den bakomliggande biologiska frågeställningen. Det innebär att den fortsatta analysen kommer att kräva olika bioinformatiska metoder. Kursen ger exempel på ett stort antal bioinformatiska tillämpningar för att besvara olika frågeställningar, t.ex. klassificering av gAfter assembling of data, generated by new sequencing methods such as "next generation sequencing", the results must be linked to the underlying biological questions. It implies that the subsequent analysis will require different bioinformatics methods. The course gives example of a large number of bioinformatics applications to answer different issues e.g. classification of genetic variants ("var

Kursen omfattar planering, genomförande och redovisning av en del av ett forskningsprojekt. Projektet ska ha anknytning till bioinformatisk utbildning. Kursen ingår i Masterprogrammet i BioinformatikIn this courses, you learn how to plan and carry out a project in Bioinformatics from start to end. The course is open for students on the Master's programme in Bioinformatics  

Kursens övergripande mål är att den studerande med stor självständighet skall genomföra ett vetenskapligt projekt inom ett väl definierat bioinformatiskt ämnesområde. Vi erbjuder masterexamensarbete i bioinformatik omfattande 30, 45 eller 60 högskolepoängYou can perform a Master's Degree project of 30 (BINP50), 45 (BINP51) or 60 (BINP52) credits in Bioinformatics. To be able to apply for a Master´s Degree Project in Bioinformatics you should be enrolled in the Masters Program in Bioinformatics at Lund University, and should have completed 45 credits of relevant advanced level courses within the programme.  

Kursen börjar med en introduktion till organismernas uppkomst, indelning och mångfald, inklusive definition och uppkomst av liv, fylogenier, systematik, taxonomi, artbegrepp, artbildning och biogeografi. Biologiska och molekylärbiologiska modellorganismer introduceras. Därefter behandlas cellens uppbyggnad och sammansättning hos mikroorganismer, växter och djur. Struktur och funktion av biomThe course starts with an introduction to the origin, classification and diversity of organisms, including the definition and origin of life, phylogenies, systematics, taxonomy, the species concept, speciation and biogeography. Biological and molecular biological model organisms are introduced. The course thereafter covers the structure and composition of cells in microorganisms, plants and anima

I kursen behandlas nedärvningssystem, mekanismer för könsbestämning, meios, rekombination, genkartering och kromosomanalys. Ytterligare områden som ingår i kursen är differentieringsgenetik, transkription och translation. Vidare behandlas genomorganisation, mutationer och mobila DNA-element, reparation av DNA-skador, genexpression och dess reglering i olika typer av organismer. Bakteriers gen

Följande områden studeras: livsformer, organisationsnivåer och byggnadsplaner systematisk indelning, klassificering och fylogeni baserad på strukturella och molekylära data artbegrepp och evolutionära processer biologisk variation och anpassningar livscykler och reproduktionsbiologi ekonomiskt betydelsefulla organismer (inklusive kulturväxter) högre växters uppbyggnad ochThe eukaryotic organism world is studied from an evolutionary and functional perspective: life forms, organizational levels and morphology systematics classification and phylogeny based on structural and molecular data the species concept and evolutionary processes biological variation and adaptations life cycles and reproductive biology economically important organisms (including cult

Kursen inleds med att kartlägga kopplingen mellan modern biologisk undersökande vetenskap och metoder, hypotestestning samt etik inom forskning. Du kommer att lära dig att: tillämpa grundläggande begrepp såsom noggrannhet, precision, sannolikhet och fördelning planera biologiska experiment utifrån en frågeställning hantera och sortera biologiska data statistiskt analysera och tolkaThe course starts with a survey of the connection between modern biological investigating research, methods, hypothesis testing and ethics in science. Thereafter statistics and probability theory, data management, statistical analytical methods for biological experiments, experimental design, as well as evaluation of experiments, is treated. You will learn to: apply basic concepts such as acc

Kursen omfattar bestämningsövningar av ryggradslösa djur observationer, insamlande och artbestämning av ryggradsdjur och ryggradslösa djur i fält en översikt av vanliga och viktiga djurgrupper bestämningsövningar av kärlväxter och demonstrationer av arter i sin naturliga miljö demonstrationer av växternas pollinations- och reproduktionsanpassningar, samt variation inom populationer ochThe course include: invertebrate identification exercises observation, collection and species identification of vertebrates and invertebrateanimals in the field an overview of common and important animal groups that should be learnt according to a specific protocol identification exercises with vascular plants and demonstrations of species in their natural environment demonstrations of

Kursen fokuserar på ekologens uppgifter/kontaktytor i samhället vad gäller naturvård. Hur och av vilka sköts den svenska skogen och hur kan man som ekolog påverka skötseln? Hur har kulturlandskapet utvecklats och hur sköter man i dag ett konventionellt respektive ekologiskt jordbruk, är frågor som tas upp under kursen. Kommunerna har planmonopol dvs de har till uppgift att planera markanvändningenThe overall aim of the course is that the student should understand the societal impact on Swedish nature, including forestry and agriculture, as well as the need and organisation of nature preservation. The function of the County Administrative Board and the Swedish Environmental Protection Agency. Sweden's environmental goals. Threatened biotopes and threatened species in Sweden. The developm

Kursens övergripande mål är att studenten ska kunna beskriva hur kroppen är uppbyggd, redogöra för viktiga fysiologiska processer och hur dessa regleras, samt göra jämförelser mellan olika djurgrupper och relatera fysiologiska anpassningar till olika miljöer. Kursens behandlar allmänna principer för organs och vävnaders uppbyggnad och funktion samt fysiologiska styrmekanismer. Människans och andraThe overall aim of the course is that the student shall be able to describe how the morphology of the body, account for important physiological processes and how these are regulated as well as make comparisons between different animal groups and relate physiological adaptations to different environments. The course treat general principles structure and function of organs and tissues as well as ph

Kursen behandlar följande områden: grundläggande evolutionsteori och populationsgenetik populationsekologi: hur populationer tillväxer och regleras, möjliga interaktioner mellan individer inom en population och mellan olika populationer interaktioner mellan arter, inklusive konkurrens, predation och mutualism terrestra, limniska och marina ekosystem: abiotiska faktorer och organismer, inThe course includes the following topics: basic evolutionary theory and population genetics population ecology how populations grow and are regulated, possible interactions between individuals within a population and between different populations interactions between species including competition, predation, and mutualism terrestrial, limnic, and marine ecosystems abiotic factors and organi

Kursen behandlar följande områden: grundläggande evolutionsteori och populationsgenetik populationsekologi: hur populationer tillväxer och regleras, möjliga interaktioner mellan individer inom en population och mellan olika populationer interaktioner mellan arter, inklusive konkurrens, predation och mutualism terrestra, limniska och marina ekosystem: abiotiska faktorer och organismer biogeografi, The course includes the following topics: basic evolutionary theory and population genetics population ecology: how populations grow and are regulated, possible interactions between individuals within a population and between different populations interactions between species including competition, predation, and mutualism terrestrial, limnic, and marine ecosystems abiotic factors and organisms, i

Kursen syftar till att ge fördjupade kunskaper i kärlväxternas art- och formrikedom. Förutom att ge ökad artkännedom ger kursen träning i användning av bestämningslitteratur, ökad förmåga att analysera växtsamhällen, och att genomföra självständiga inventeringar av floran. Kursen ges nästa gång sommaren 2023. Alla praktiska fältmoment genomförs i form av dagsutflykter från Lund. Praktiska moment The course consists of floristics with exercises in identification of different vascular plants. Overview of cultivated plants. Study of intraspecific variation, species delineation, as well as ecology and distribution of species. Information about methods for collection, preparation and storage of plant material. Studies of natural plant communities and how these are influenced by man. Inventory

Kursen innehåller populärvetenskapliga föreläsningar om bland annat: människans ursprung, evolution av sjukdomar, stress och immunförsvar, mänskliga livshistorieegenskaper och hur de har utvecklats genom naturligt urval, mänskligt partnerval och sexuellt urval, evolution av mänskligt samarbete, konkurrens och själviskhet, evolutionära aspekter på mänsklig sexualitet, friskvård i vardagen; samt mänThe course consists of lectures and two discussion seminars about current literature on human evolutionary biology. During the lectures, different themes are addressed with a specialisation on: exercise physiological and evolutionary aspects on physical activity appetite regulation and energy balance the genetic basis of ADHD and hereditary diseases and syndromes evolutionary medicine