Quality Control for high-throughput Quantitative Proteomics - Harnessing the potential of label-free LC-MS
Popular Abstract in Swedish Sedan kartläggningen av det mänskliga genomet, har mer fokus lagts på dess produkt, proteomet, som definieras som de proteiner som uttrycks i en cell vid en viss tidpunkt. Proteomets dynamiska egenskaper gör det till en fantastisk källa för så kallade biomarkörer, det vill säga molekyler som genom deras koncentrationsmönster kan användas för att särskilja sjuka och frisMultiplex protein quantification, proteomics, is essential for uncovering new biomarkers and understanding biology. Liquid chromatography coupled to mass spectrometry (LC-MS) is the predominant technique for these measurements. In this thesis, optimization and quality control strategies for different phases of the LC-MS pipeline have been developed. Due to the inherent complexity and dynamic rang