Extracting protein flexibility features from a pre-trained protein language model
AI tar oss ett steg närmare en lösning till gåtan bakom flexibla proteiner Proteiner är byggstenarna till det mikroskopiska maskineri som utför i stort sett alla biologiska processer i naturen. När vi vill utveckla läkemedel för att lösa problem som kan uppstå i maskineriet eller bekämpa angripande patogener är förståelse av proteiners 3-dimensionella struktur ovärderlig. Visualisering av proteinThe deep learning revolution has contributed to a great leap in protein structure prediction, but predicting the multiple conformational states that proteins can hold remains an open problem. This thesis approaches this problem through the use of MSA Transformer, a protein language model pre-trained on multiple sequence alignments, that has demonstrated the ability to learn protein properties such
