The human gut microbiota and type 2 diabetes: comparison of several methodological approaches to analyzing microbiome sequence data
Tarmflora och typ 2-diabetes – kan vi hitta sambanden? Typ 2-diabetes är ett ökande globalt hälsoproblem. 2017 levde uppskattningsvis 450 miljoner vuxna världen över med diabetes, och en konservativ prognos indikerar att detta antal kan öka till 700 miljoner år 2045. Den stora majoriteten (mer än 80%) av dessa diabetesfall är typ 2-diabetes. Det är väl känt att otillräcklig fysisk aktivitet, ohälThis study explores the correlation between type 2 diabetes status and gut microbiota composition, diversity and functional capacity in a Swedish cohort. Using 16S ribosomal RNA sequencing metagenomic data sampled from 2161 individuals, out of which 107 also had their metagenomic data sequenced using whole genome shotgun sequencing, modern bioinformatics tools were used to extract information on t