Utilizing Different Simulation Methods to Study the Structure and Aggregation of Amyloidβ, the Alzheimer Peptide
Alzheimers sjukdom är den vanligaste orsaken till demens och omkring 100 000 svenskar beräknas lida av sjukdomen. Runt om i världen beräknas ungefär 50 miljoner människor lida av Alzheimers sjukdom. En peptid som är inblandad i sjukdomen är Amyloidβ som kan vara olika lång beroende på vilka APP-sekretas som klyver Amyloid-βproteinprekursor. I den här studien har de peptider med 40 (Amyloidβ40), reIn this study, the two peptides Aβ40 and Aβ42, which are related to Alzheimer’s disease, was studied. The aim was to study them in bulk solution, to understand if, and in that case how, the two peptides differ in structure and aggregation be- haviours. To investigate the structure, all-atom moleuclar dynamics simulations were used, whereas the aggregation was studied using coarse-grained Monte Car